Bei ihrer Reise durch die Einall-Region erreichen Ash und seine Freunde Lilia und Benny die Stadt Eindoak Town. Dort erzählt man sich eine Legende über die Schwertburg, ein Wahrzeichen der Stadt, die vor langer Zeit ihren vorigen Standort im Tiefland verlassen haben soll und an ihre jetzige Position gebracht wurde, um eine zerstörerische Kraft, die Drachenenergie, zu versiegeln. Während des Erntedankfestes der Stadt lernen die Freunde das mystische Pokémon Victini kennen, dessen Kraft angeblich dazu verwendet wurde, um die Schwertburg zu bewegen, sowie Damon und seine Familie. Damon hat den Plan, mithilfe des legendären Pokémon Reshiram und mit Victinis Kraft die Schwertburg wieder zurück ins Tiefland zu bringen, um die Gegend wieder zum Leben zu erwecken und den Wunsch seiner Mutter zu erfüllen. Doch hat dieses Unterfangen gefährliche Konsequenzen und Ash muss Zekrom, ein weiteres legendäres Pokémon, zur Hilfe holen, um Schlimmeres zu verhindern.
Anmerkung:
Dieser Film ist beinahe mit dem Film Pokémon - Der Film: Schwarz - Victini und Reshiram identisch, doch weisen beide Filme einige Unterschiede auf ‒ so sind die Rollen der Pokémon Reshiram und Zekrom jeweils vertauscht.