Yu-Gi-Oh! Vrains spielt in Den City, einer Stadt in der Netzwerk-Systeme entwickelt werden. Auch der Firmenriese SOL Technology Co. hat seinen Sitz in der Stadt und nutzt die fortschrittliche Technologie, um sogenannte „Link Vrains“, ein virtueller Raum, zu konstruieren. Doch in diesem Raum erscheint…mehr anzeigen
Während Zaizen und Ghost Girl weiter in Richtung Datenbank unterwegs sind, stellt sich Blue Angel einem Duell gegen einen der KI-Duellanten. Derweil muss sich auch Playmaker aus seiner misslichen Lage befreien.