Yu-Gi-Oh! Vrains spielt in Den City, einer Stadt in der Netzwerk-Systeme entwickelt werden. Auch der Firmenriese SOL Technology Co. hat seinen Sitz in der Stadt und nutzt die fortschrittliche Technologie, um sogenannte „Link Vrains“, ein virtueller Raum, zu konstruieren. Doch in diesem Raum erscheint…mehr anzeigen
Nach Revolvers und Playmakers Duell kehrt wieder Ruhe ein. Ghost Girl recherchiert derweil weiter in LINK VRAINS. Yuusaku seinerseits ist mit der Geheimhaltung seiner Identität beschäftigt.