Die SOS-Brigade ist zurück in der Schule, Kyon entwirft ihre neue Website und Haruhi kommt mit ihrem Logo, das Kyon verabscheut. Nichts passiert wirklich, bis Haruhi bemerkt, dass etwas mit dem Logo nicht stimmt und später ein überraschender Besucher eintrifft und den SOS um Hilfe bittet. Sie behauptet, dass ihr Freund (der Präsident der Computer Society) von der Erde verschwunden und nie zurückgekehrt ist. Also geht der SOS in seine Wohnung, um Nachforschungen anzustellen und kehrt mit nichts zurück. Itsuki und Yuki wissen jedoch, dass etwas nicht stimmt, also bringen sie Kyon und Mikuru zurück in die Wohnung.