Unser Erzähler Kyon, ein normaler Mensch, hat gerade die North High School betreten, ohne irgendwelche Bestrebungen. Er hat seine Kindheitsphantasien von Aliens, Zeitreisenden und Espern abgelegt und hofft auf ein eintöniges Schuljahr. Dann trifft er Haruhi Suzumiya, ebenfalls eine Erstklässlerin, die sich für Außerirdische, Zeitreisende und Esper interessiert und sich nicht um Menschen kümmert. Es wird angenommen, dass sie eine sehr verschlossene, aber exzentrische Person ist, die Linien über den Schulhof ihrer Mittelschule gezogen haben soll, um Außerirdische anzulocken.