Begierig auf Vergeltung erklärt die Atlantische Föderation der ZAFT (die sie für den Absturz von Junius-7 verantwortlich macht) den Krieg. Zur Verteidigung des bevorstehenden nuklearen Angriffs entfesselt die ZAFT ihre neueste Waffe, den Neutron Stampeder, gegen die Streitkräfte der Atlantischen Föderation.