Als Strafe für die Schäden, die Lacias und Methodes heftiger Kampf verursacht hat, wird Arato zwei Wochen von der Schule supendiert und muss außerdem 4,5 Millionen Yen abstottern. Um sich bei seinem Vater Kozo zu entschuldigen, der die Hälfte davon übernehmen will, fährt Arato mit Lacia, Yuka und Ryo nach Tsukuba, wo in einer Laborstadt ein großes hIE-Experiment durchgeführt wird.