Als Kaito und die anderen nach Japan zurückkehren, stellen sie fest, dass der Direktor, Baron Kaido, verschwunden ist. Später wird Kaito von der POG an den Ort gerufen, an dem seine Eltern starben. Als Kaito und die anderen am Ort ankommen und Baron finden, erhält Kaito ein Video, das zeigt, dass seine Eltern POG-Geber waren, die sein Potenzial für Phi Brain überwachten. Baron enthüllt weiter, dass sie nicht seine richtigen Eltern waren, und gibt sich als POG-Mitglied zu erkennen. Baron beschließt, Kaito alles über das Phi Brain-Projekt zu erzählen, und enthüllt, dass seine Eltern gegen die Befehle der POG verstoßen und anstelle von Kaito das Fool's Puzzle genommen haben, das sie getötet hat, um ihn zu beschützen. Baron zeigt Kaito ein weiteres Video, das zeigt, dass sie ihn wirklich wie ihr eigenes Kind liebten, obwohl sie nicht seine richtigen Eltern waren, was auch Rook schockiert. Entschlossen, seinen Eltern einen angemessenen Abschied zu bereiten, aktiviert Kaito seinen Orpheus-Zustand und löst das Narrenrätsel ein für alle Mal. Nachdem er Kaito gesagt hat, dass Jin von der POG gefangen gehalten wird, geht er und wird von der POG für seinen Verrat gefangen genommen.