25 Jahre vor dem Beginn der Handlung tauchten auf der ganzen Welt riesige Kreaturen auf, die als Drachen bekannt waren und große Zerstörungen anrichteten, bevor sie so schnell wieder verschwanden, wie sie aufgetaucht sind. Kurz darauf wurden Menschen mit drachenähnlichen Kräften geboren und wurden daraufhin als "Typ Drache" oder einfach nur "D" bekannt. In der Gegenwart wird der einzige männliche "D", Mononobe Yuu, nach Midgard verschleppt und trifft am Strand auf das nackte Mädchen Iris Freyja. Iris hält ihn für einen Eindringling und versucht erfolglos, ihn anzugreifen, verliert dann aber das Bewusstsein, weil ihr Angriff nach hinten losgeht, und wird von ihm gerettet. Während die beiden sich unterhalten, wird Yuu von seiner Schwester, Mitsuki Mononobe, angesprochen, die ihm verkündet, dass er von nun an ein Midgard-Schüler sein wird.