Team Kakashi hat mit dem mysteriösen Tobi mehr Schwierigkeiten, als erwartet. Er kann allen angewendeten Jutsus ausweichen. Wie, bleibt sein Geheimnis. Selbst Shino, der endlich eine Chance sieht, sich zu beweisen, hat mit seinen Insekten nicht den gewünschten Erfolg. Und plötzlich tauchen noch weitere Gegner auf, die zu Akatsuki gehören. Es beginnt ein Wettlauf mit der Zeit, als Kakashi und seine Leute hören, dass Sasuke in Gefahr ist. Der Kampf mit Itachi hat ihm ziemlich zugesetzt. Er ist kraftlos, und zu alledem vertraut ihm Madara an, dass auch er ein Überlebender des Uchiha-Clans ist.