Am Anfang unterhält sich Kabuto Yakushi mit Tobi. Tobi will etwas erledigen und das Versteck verlassen. Erst nach mehrmaligen Nachfragen erfährt Kabuto den Ort, wo Tobi hin möchte. Tobi reist nach Amegakure und spürt Konan auf. Konan ist nach dem Angriff auf Konohagakure und dem Tod von Nagato aus der Organisation Akatsuki ausgetreten. Naruto Uzumaki zeigte ihr nach eigenen Aussagen den Weg. Sie trägt aber dennoch den Mantel von Akatsuki, da sie diesen Mantel als eine Art Verbindung zu Yahiko und Nagato ansieht. Tobi, der sie als Verräterin bezeichnet, versucht ihr Informationen über Nagatos Grab zu entlocken. Er möchte sein Rin'negan wieder zurück. Konan greift Tobi frontal an und zerstört mithilfe einer Papierexplosion dessen rechten Arm sowie einen Teil seiner Maske. Auch Konan wird von dieser Explosion verletzt.