Yamato und seine Freunde kämpfen gegen unbekannte, gepanzerte Aliens in ihren Maschinen. Umgeben von einem elektromagnetischen Zaun wird Musashi immer wieder angegriffen. Die Angriffe führen dazu, dass Ryugo sich an seine echte Mutter erinnert. Als es um alles oder nichts geht, lernt Yamato von einer unerwarteten Person, wie man mit dem Dark Hunter fertigwerden kann.