Popura Taneshima ist ein zu klein geratenes High-School-Mädchen, das in einem Familienrestaurant namens Wagnaria arbeitet und vom Manager aufgefordert wird, einen neuen Mitarbeiter zu finden. Nachdem sie Fremde und Freunde befragt hat, findet sie einen Jungen aus ihrer Schule namens Sōta Takanashi, der sich bereit erklärt, im Restaurant zu arbeiten. Sōta gewöhnt sich schnell an die Arbeit bei Wagnaria, während er die anderen Mitarbeiter trifft und ihre verschiedenen Macken lernt. Sōta gerät nach einem Kommentar zu ihrem Alter auf die schlechte Seite des Managers Kyōko Shirafuji, was dazu führt, dass sie ihn mehrere Wochen lang überarbeitet. Eines Tages hat Sōta dieselbe Schicht mit Mahiru Inami, einem Mädchen, das er noch nicht kannte, das an Androphobie leidet und Sōta beim ersten Treffen ins Gesicht schlägt.