In einer postapokalyptischen Zukunft ist das in Ruinen liegende Japan weitestgehend in Grün gehüllt. Die Regierungen auf der Welt regulieren den Ausstoß von Kohlenstoffemissionen mit eiserner Hand, was zu einem noch stärkeren Gefälle zwischen den Klassen führt. Die Reichen leben in der utopischen Stadt Atlas, während die Armen in den Ruinen und Wäldern in behelfsmäßigen Städten leben müssen. Doch unter denen gibt es eine Organisation namens Metal Age, die sich dem widersetzt. Deren zukünftige Anführerin Kuniko Hojo kehrt nach einem zweijährigen Gefängnisaufenthalt wieder zurück, was die Ereignisse ins Rollen bringt.