Unsere Freunde wollen sich an ihrem letzten Tag in Graphit-Port-City ein wenig entspannen. Ash und Max machen sich auf den Weg, um sich das Marine-Museum der Stadt anzusehen. Leider ist es an diesem Tag geschlossen, aber sie lernen Marius und Captain Brigg kennen, der der Leiter des Museums und Wasserpokémon-Forscher ist. Er will gerade eine geheimnisvolle Gesteinsprobe untersuchen, als plötzlich Team Magma auftaucht und ihm die Probe abnehmen will. Natürlich ist auch Team Rocket zur Stelle, das sich Pikachu schnappen und das Museum ausplündern will, was wie immer misslingt. Leider schafft es Team Magma nach einem Kampf mit einem Großteil der Gesteinsprobe zu entkommen, aber Captain Brigg hat noch einen kleinen Rest davon übrig, um mit seiner Forschungsarbeit fortfahren zu können. Unsere Freunde machen sich auf den Weg nach Malven-Froh-City, wo die nächste Pokémon-Arena auf sie wartet…